深圳首例H5N6流感病例病毒基因確定
南方日報訊 2015年12月29日，深圳市報告了1例H5N6流感病例。1月3日，筆者從深圳市疾控中心獲悉，經(jīng)全基因組序列分析結(jié)果顯示，目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒，本次報告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源，從生物信息學(xué)角度證實本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的。
此次報告的H5N6流感病例為深圳首例，全球第五例H5N6流感病例。病例出現(xiàn)后，深圳市疾控中心與華大基因合作，立即對患者咽拭子樣本和活禽市場外環(huán)境樣本分離出的H5N6流感病毒進行基因測序。經(jīng)過晝夜奮戰(zhàn)，1月3日上午10時，完成了全基因組序列分析。
基因測序結(jié)果顯示，患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年廣東省從鴨只中分離的H5N6病毒高度同源，同源性>98%；與深圳2014年活禽市場外環(huán)境分離出的H5N6病毒高度同源，同源性>98%；與深圳2015年12月份來自外環(huán)境標本分離出的3株H5N6病毒高度同源。
同時，患者樣本中H5N6病毒HA、NA基因與2014年四川和廣東報告的2例H5N6流感病例的病毒高度同源，同源性>98%?；颊邩颖局蠬5N6病毒的內(nèi)部6個基因與本地外環(huán)境中H9N2病毒高度同源，H9N2病毒為該病毒的內(nèi)部骨架供體。患者樣本中H5N6病毒HA和NA基因分別來源于外環(huán)境中的H5N1病毒和H6N6病毒。
經(jīng)過測序分析認為，目前深圳活禽市場外環(huán)境存在H5N6流感病毒，本次報告病例的病毒與活禽市場外環(huán)境的病毒高度同源，從生物信息學(xué)角度證實本次病例是因接觸活禽或市場外環(huán)境感染的。因此，減少人與活禽密切接觸的機會，可有效預(yù)防人感染H5N6流感。其中一個重要的措施是切實推行活禽集中屠宰、冷鏈配送、生鮮上市。該措施在國際上被普遍認可，發(fā)達國家在上世紀二三十年代就開始推廣禽類生鮮上市，目前，歐美、日本等發(fā)達國家和我國港澳地區(qū)已實行生鮮禽類代替活禽上市。對于市民，需要做到盡量不直接接觸和處理活禽，不食用病死禽，不購買來源不明的禽鳥類產(chǎn)品。
此外，深圳市疾控中心也發(fā)現(xiàn)感染人的基因來源比較復(fù)雜，至少經(jīng)歷H5N1流感病毒與H6N6流感病毒的重配，然后重配的H5N6流感病毒再與H9N2流感病毒重配，產(chǎn)生目前感染人的H5N6流感病毒。具體的病毒重配過程，還在深入研究中。
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